ניתן לסווג אסטרים על סמך החומצה הספציפית ממנה הם מופקים. הנפוצים ביותר הם אסטרים של חומצה קרבוקסילית, הנוצרים בתגובה של חומצה קרבוקסילית ואלכוהול-. דוגמאות כוללות אתיל אצטט ומתיל פרופיונאט. בנוסף לאלה, ישנם אסטרים של חומצה אנאורגנית-כגון סולפטים ופוספטים-שמוצאים יישום משמעותי במגזרים תעשייתיים וכימיים; דוגמאות כוללות דיאתיל סולפט וטריפניל פוספט. בהתאם לסוג החומצה המעורבת, המאפיינים, היישומים והיציבות של האסטרים המתקבלים ישתנו.
ניתן לסווג אסטרים גם לפי סוג האלכוהול המשמש להיווצרותם. אם נוצרים מאלכוהול רוויים, הם בדרך כלל מניבים אסטרים של חומצות שומן פשוטות, כגון טריגליצרידים; לעומת זאת, אם נוצר מאלכוהול בלתי רווי, התוצאה היא אסטר בלתי רווי, כגון גליצריל אולאט. אלכוהולים בעלי מבנים מיוחדים-כגון אלכוהול מחזורי או אלכוהול ארומטי-יכולים גם להגיב עם חומצות כדי לייצר אסטרים מחזוריים או ארומטיים מתאימים; סוגים אלה של אסטרים משמשים לעתים קרובות בתעשיות הריח, חומרי הטעם והתרופות.
בהתבסס על המבנה והיישום שלהם, ניתן לסווג אסטרים באופן נרחב לאסטרים פשוטים, אסטרים מורכבים ואסטרים פונקציונליים. אסטרים פשוטים נוצרים בדרך כלל מתגובה של חומצה חד-קרבוקסילית עם מונו-אלכוהול, והם משמשים בדרך כלל כממיסים או חומרי ריח. אסטרים מורכבים-כגון טריגליצרידים ופוספוליפידים-מהווים מרכיבים חיוניים של שומנים טבעיים. אסטרים פונקציונליים כוללים את אלה המכילים קבוצות פונקציונליות ספציפיות-כגון פוליאסטרים-והם נמצאים בשימוש נרחב בתעשיות הפלסטיק והסיבים. מערכות סיווג שונות אלו מאפשרות הבנה מעמיקה יותר של התכונות והיישומים המגוונים של אסטרים.
